유전자 분석 방법

개요

DNA 변이체 검출 혹은 알려졌거나 새로운 RNA 융합체 식별 중 어느 것에 관심이 있든, 복잡한 워크플로우와 긴 처리 시간 및 제한적인 검체는 진행을 방해하고 비용을 증가시키며 실행 가능한 데이터를 지연시킬 수 있습니다. 당사의 고성능 DNA 염기서열 분석(DNA-seq) 기술은 이러한 문제를 극복하도록 최적화되어 있기 때문에, GC 풍부 영역을 확신을 가지고 염기서열을 분석하고 빈도가 낮은 변이체를 정밀하게 식별하며 품질이 낮거나 제한적인 투입 검체를 최대한 활용할 수 있습니다. 맞춤형 패널이 필요한 경우 당사 전문가가 지능형 패널 설계를 도와드립니다.

QIAseq이 제공하는 유전체 통찰력

QIAseq 솔루션은 편향(bias)을 최소화하고 유전체 적용 범위, 균일성 및 정밀도를 최대화하기 위해 다음과 같은 혁신을 기반으로 합니다.

앰플리콘 염기서열 분석

뛰어난 염기서열 분석 메트릭스

균일성: 표준 패널은 일반적으로 평균 적용 범위의 0.2x에서 99.5%, 평균 적용 범위의 0.5x에서 96%의 균일성을 달성합니다.

민감도: 빈도가 낮은 DNA 변이체를 검출(calling)할 때 더 높은 신뢰도를 얻습니다. 표준 패널은 1% NA12878 SNP에 대해 90%를 초과하는 민감도를 얻을 수 있으며 메가베이스 영역당 15개 미만의 위양성을 갖는 전형적인 코딩 영역에 대한 삽입결실(indel)을 얻을 수 있습니다.

더 많은 멀티플렉싱: 다른 공급업체의 제품은 96개 검체 멀티플렉싱을 제공합니다. QIAseq은 여기에서 멈추지 않습니다. QIAseq 특정적인 색인을 사용하여 384개의 검체를 멀티플렉싱할 수 있습니다.

주요 성공 사례

단일 프라이머 확장 대비 2-프라이머 앰플리콘 접근법

표적 염기서열 분석 방법의 일대일 비교를 통해 단일 프라이머 확장(single primer extension, SPE) 방법이 우월한 이유를 알 수 있습니다.

검체 혼동 감소 및 염기서열 분석 처리량 최대화

고유한 이중 색인(Unique Dual Indices, UDI)이 최고 수준의 공정 안전성을 제공하고 “색인 건너뛰기(index hopping)” 및 판독 오배정을 완화하여 데이터 염기서열 분석에 대한 확신을 보장합니다. UDI를 사용하여 염기서열 분석 처리량을 극대화함으로써 검체당 염기서열 분석 비용을 낮출 수 있습니다. UMI와 UDI의 조합은 QIAseq Targeted Panels이 전례 없는 수준의 정확도를 제공함을 의미합니다.

전장 엑솜 염기서열 분석

최단 시간 내에 검체에서부터 질병 통찰력 얻기

검체에서 표준화된 변이체 분류 및 해석으로 가기까지의 처리 시간이 단축된, 최적화된 하나의 엑솜 염기서열 분석 파이프라인.

전장 유전체 염기서열 분석

메타지노믹스

2020년 웨비나 하이라이트

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당사의 고성능 QIAseq 기술과 탁월한 전문 지식 및 지원 결합

유전체 혁명에 참여하세요! QIAGEN과 협력하여 >20년 이상의 Sample to Insight 솔루션의 경험의 이점을 누리세요. 패널 디자인에서 분석에 이르기까지 당사의 Enterprise Genomic Solution은 바이오마커 발견을 단순화하여 귀하의 연구가 앞으로 나아가게 합니다.

유전자검사

유전자검사목적

유전자는 아주 작은 부분의 이상이나 결손만 생기더라도 기형, 유전성 질환 그리고 암과 같은 다양한 건강문제들을 초래할 수 있습니다.
이러한 유전자 이상을 찾아내기 위해 시행되는 검사가 유전자 검사이며 관련된 질병의 예방, 진단 그리고 치료계획을 수립하기 위한 목적으로 이용됩니다.
특히 암의 경우는 DNA 돌연변이에 의해 발생하는 가장 대표적인 질환이며 다양한 돌연변이들이 암 발생에 관여하게 됩니다. 그러므로 단일 유전자 또는 특정 유전자 부위만을 확인하는 검사 방법 보다는 대용량의 유전자정보로부터 원인 유전자들을 찾아낼 수 있고 유전체 변이에 대한 패턴 분석이 가능한 차세대 염기서열분석(NGS) 기반 암 유전자패널 검사가 널리 시행되고 있습니다.

차세대염기서열분석법(Next Generation Sequencing_NGS) 이란

차세대염기서열분석법은 수십~수백 개의 유전자를 한번 에 대량으로 검사하여 질병의 원인 유전자를 찾아내는 새로운 유전자 분석 기술을 말합니다.
이전 유전자 분석기술로는 개인의 유전체 분석을 위해 막대한 시간과 비용이 요구되었으나 차세대염기서열분석법의 개발로 이러한 한계점을 극복하여 빠른 시간 안에 상대적으로 저렴한 비용으로 개인의 유전체를 한번에 대량으로 처리할 수 있게 되었습니다. 뿐만 아니라 특정 유전자가 전체 암 덩어리에서 몇 퍼센트나 있는지 수치화하는 것이 가능해 졌으며, 치료 후 시간 경과에 따른 유전자의 변화 양상까지 찾아낼 수 있게 되었습니다.

차세대염기서열분석 기반 유전자패널 검사 선별급여 적용

차세대염기서열분석법을 기반으로 한 유전자패널 검사는 2017년 3월부터 우리나라에서도 선별급여(본인부담률 50%)로 건강보험적용이 가능해졌으며 대상 질환은 아래와 같습니다. [보건복지부 고시 제2019-75호]

유전자 분석 방법

NGS 유전자패널 검사를 통해 얻을 수 있는 것들

유전자 분석 방법

질병의 진단, 질환 발생 가능성 예측, 조기 발견

질환 별 NGS 패널 검사를 통해 의심 질환과 관련된 유전자 이상 여부를 확인하여 진단에 도움을 줄 수 있습니다.
특히 희귀질환과 같이 정확한 진단을 위해 질환의 원인 유전자를 분석하는 것이 매우 중요한 질환의 경우 NGS 패널을 활용하면 진단에 소요되는 비용과 시간을 절감할 수 있습니다.
또한 유전성 질환과 관련된 변이 유무를 확인하여 환자 뿐 아니라 가족에 대한 유전성 질환발생 가능성을 예측해 볼 수 있으며 조기 발견 및 예방을 위한 적극적 검진과 의료적 중재를 고려할 수 있습니다.

맞춤형 항암 치료 가능

1) 표적 치료
암의 특정 유전자 변이를 표적으로 하는 승인된 표적 약물 또는 임상시험 중인 표적 약물이 있을 경우 고형암 NGS 패널 검사를 통해 그에 맞는 타겟 유자가 변이가 있는지 확인 하여 표적치료제 사용을 고려해 볼 수 있습니다.
또한 암이 재발하거나 일반적인 치료에 잘 반응하지 않고 악화되는 경우 암의 유전적 변이가 추가적으로 발생하였는지 NGS 암 패널 검사를 통해 확인 할 수 있고 그에 따른 치료계획을 수립 하는데 도움을 줄 수 있습니다.

2) 면역 치료
면역 항암제는 우리 몸의 면역세포 활성화를 통해 암세포를 공격하는 방법으로 다른 항암제에 비해 부작용은 훨씬 적으나, 매우 고가의 치료제이고 그 효과는 환자마다 모두 다르게 나타날 수 있습니다.
이러한 면역항암제의 치료 반응을 예측할 수 있는 지표들을 NGS 패널 검사로 확인 할 수 있고 그 결과에 따라 치료 효과가 기대되는 환자들을 선별하여 효과적인 면역 항암제의 처방이 이루어 질 수 있도록 도움을 줄 수 있습니다.

분당서울대학교병원 NGS 유전자패널 검사 정보

분당서울대학교병원에서는 암, 희귀질환 등 유전자 변이와 관계된 다양한 질환군에서 차세대염기서열분석법을 활용하여 유전자패널 검사를 시행 하고 있으며 생물정보학 전문가가 분석과정에 참여하여 정확도 및 신뢰성 높은 검사 결과를 도출하고 있습니다.

암 패널

구분검사명대상검체유전자
비유전성 SNUBH pancancer - TruSight Oncology 500 LVII 산발성고형암 조직 523종
비유전성 혈액암패널 (AML) 산발성혈액암 혈액 38종
비유전성 혈액암패널 (MDS/MPL) 산발성혈액암 혈액 38종
유전성 유전성암 패널 유전성암 혈액 30종
유전성 유전성대장암 패널 유전성대장암 혈액 12종
유전성 유전성유방암 패널 유전성유방암 혈액 11종
유전성 유전성난소암 패널 유전성난소암 혈액 12종

희귀 유전성 질환 패널

검사명대상검체유전자
유전성 난청 (mild) 유전성난청 혈액 29종
유전성 난청 (severe) 유전성난청 혈액 30종
유전성망막디스트로피 (Level I) 유전성망막색소변성 혈액 20종
유전성망막색소변성 (Level II) 유전성망막색소변성 혈액 89종
유전성비대성심근병증 유전성심근병증(비후성) 혈액 29종
유전성확장성심근병증 유전성심근병증(확장성) 혈액 30종
유전성뇌전증(Focal) 유전성뇌전증(국소발작) 혈액 26종
유전성뇌전증(Early onset) 유전성뇌전증(조기발병) 혈액 29종
유전성당뇨병 유전성당뇨병 혈액 20종
유전성적혈구증가증 유전성적혈구증가증 혈액 10종
유전성용혈빈혈 유전성용혈빈혈 혈액 30종